阴茎皮下米粒大的疙瘩可能是皮脂腺异位症、珍珠状阴茎丘疹、尖锐湿疣等原因导致，患者需要根据不同病因采取不同的治疗措施。
1、皮脂腺异位症阴茎皮肤上凸起的丘疹，不出现红肿、疼痛等症状，可以长期存在，一般无需特殊处理。
2、珍珠状阴茎丘疹分布在龟头冠状沟及包皮系带两侧，为柔软的肉芽样凸起，没有疼痛和分泌物，可以长期存在，体积、大小一般不会发生变化，不具有传染性，无需处理。
3、尖锐湿疣属于性传播疾病，通过不洁性接触感染，会出现米粒大的疙瘩，可以在医生指导下使用鬼臼毒素软膏、咪喹莫特乳膏等药物治疗。
除以上比较常见的原因之外，也可能是小粉瘤等因素，需要就医检查确诊原因。
